केंद्रीय अन्तर्स्थलीय मत्स्य अनुसंधान संस्थान (सीआईएफआरआई) पश्चिम बंगाल की राजधानी कोलकाता से 20 किमी दूर गंगा नदी (भागीरथी) के पूर्वी तट पर बैरकपुर में स्थित है। अक्षांश 22o46' उत्तर और देशांतर 88o23' पूर्व है। बैरकपुर सब-डिवीजन सड़क और रेलवे दोनों से अच्छी तरह से जुड़ा हुआ है। दो राष्ट्रीय राजमार्गों, NH-34 और NH-35 के साथ-साथ अन्य महत्वपूर्ण राज्य राजमार्गों से गुजरने के साथ, अधिकांश शहर कोलकाता, हवाई अड्डे, बंदरगाह और राज्य के अन्य महत्वपूर्ण शहरी और वाणिज्यिक केंद्रों से अच्छी तरह से जुड़े हुए हैं। इसके अलावा यह हुगली नदी के महत्वपूर्ण जलमार्गों का लाभ उठाता है जो पश्चिमी भाग से होकर बहती है। बैरकपुर ट्रंक रोड (बी.टी. रोड) बैरकपुर को कोलकाता से जोड़ने वाली भारत की सबसे पुरानी धातु सड़कों में से एक है। सियालदह सेक्शन में रेलवे लाइन बैरकपुर से होते हुए राणाघाट, बोनगांव, डनकुनी, हावड़ा, बर्दवान, बंदेल तक फैली हुई है।
परिसर बैरकपुर रेलवे स्टेशन से 5 किमी और दमदम हवाई अड्डे से 15 किमी दूर है। यह संस्थान गंगा नदी के किनारे और सेरोफुली घाट के सामने स्थित है। परिसर में प्रयोगशाला भवन, प्रशासनिक भवन, गेस्ट हाउस और वैज्ञानिक घर और आवासीय क्वार्टर शामिल हैं।
